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1、水利工程對河流生態(tài)環(huán)境的影響

水利工程通常都是建立在自然河道的基礎(chǔ)上，所以水利工程的建設(shè)，會對由河流長時間的演化成的自然生態(tài)環(huán)境造成一定的影響，結(jié)果可能造成河流局部的非連續(xù)化和均一化，這樣河流在長期的作用之下，原來河流的多樣性環(huán)境就發(fā)生了改變。一些大型的水庫建在河流之上，水庫的建筑材料的獨特性質(zhì)會對水溫和水質(zhì)都造成一定程度的影響。在太陽光的強烈照射下，水溫會提高很多，這樣水質(zhì)受到影響后，水中的水生物的生活和繁殖都會受到影響。這樣的河流就不再是它的原始狀態(tài)。水利工程的建設(shè)還會降低原有的河道水的流速，這樣水面與空氣的接觸交換速率也就減小，水的自凈能力也降低。

2、水利工程建設(shè)對河道附近的生態(tài)環(huán)境的影響

水利工程建設(shè)對河道附近的生態(tài)環(huán)境的影響主要體現(xiàn)在河道周邊的植被受到的重要影響。由于水利工程的施工建設(shè)，對河道周圍的陸生生物環(huán)境造成嚴(yán)重的影響，河道理化性質(zhì)的改變，使岸邊的生物生存以及生活環(huán)境逐漸變得惡化。這樣生活在河道周圍的大部分生物由于環(huán)境的惡化會被迫遷徙，這樣施工區(qū)域的生態(tài)系統(tǒng)就失去了原有的平衡，如果沒有合理的保護措施，很可能造成物種滅絕的危險。