工程分析應涉及勘察設計期、施工期和運營期，以施工期和運營期為主，按水環(huán)境（或海洋環(huán)境）、環(huán)境生態(tài)、環(huán)境空氣、聲環(huán)境和固體廢棄物等環(huán)境要素識別影響源和影響方式，并估算源影響源強�？裳泻统醪皆O計期工程分析的重點是碼頭選址和航路選線。

施工期是航運碼頭工程產(chǎn)生生態(tài)破壞和環(huán)境污染的主要環(huán)節(jié)，重點考慮填充造陸工程、航道疏浚工程、護岸工程和碼頭施工對水域環(huán)境和生態(tài)系統(tǒng)的影響，說明施工工藝和施工布置方案的合理性，從施工全過程識別和估算影響源。

運營期主要考慮陸域生活污水、運營過程中產(chǎn)生的含油污水、船舶污染物和碼頭、航道的風險事故。海運船舶污染物（船舶生活污水、含油污水、壓載水、垃圾等）的處理處置有相應的法律規(guī)定。同時，應特別注意從裝卸貨物的理化性質及裝卸工藝分析，識別可能產(chǎn)生環(huán)境污染和風險事故。